La Universidad Autónoma de Ciudad Juárez oferta la Maestría en Ingeniería Ambiental (PMIA) con orientación a la investigación e incorporado al Padrón Nacional de Posgrados de CONACyT, con proyectos que fortalecen las líneas de investigación Ciencia y Tecnología en Estudios de Agua Subterránea, Ciencia y Tecnología del Agua, Educación e Impacto Ambiental, así como temáticas asociadas al cambio climático, energías renovables, comunicación ambiental, y estudio de la contaminación de matrices ambientales. La convocatoria de nuevo ingreso al programa es anual.